Die 2. Handball-Bundesliga startete wie in den Jahren zuvor auch in der Saison 2009/10 mit einer Nord- und einer Südstaffel. In der Saison 2009/2010 gehen 35 Vereine in der 2. Handball-Bundesliga an den Start. Aus der 1. Bundesliga waren die HSG Nordhorn-Lingen nach einer Insolvenz sowie der Stralsunder HV und TUSEM Essen als Letztplatzierte abgestiegen. Nordhorn-Lingen spielt in der Nordstaffel, Essen in der Südstaffel. Der Stralsunder HV erhielt keine Lizenz für die 2. Liga. SV Anhalt Bernburg (16., Verlierer der Relegation) und Leichlinger TV (als 17.) standen schon als Absteiger aus der 2. Liga in die Regionalliga fest. Das Präsidium der Handball-Bundesliga entschied jedoch auf Antrag der beiden Vereine, dass diese in der Saison 2009/10 in der 2. Handball-Bundesliga spielberechtigt sein werden. Die sogenannte Regelstärke (18 Clubs pro Liga) wäre in den beiden 2. Ligen deutlich unterschritten worden: Die sportlich qualifizierten SG Wallau und HR Ortenau hatten keinen Lizenzantrag gestellt bzw. durch Insolvenz die Qualifikation verwirkt.

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