Die 2. Handball-Bundesliga startete wie in den Jahren zuvor auch in der Saison 2003/04 mit einer Nord- und einer Südstaffel.
Aus der Staffel Nord stiegen TuS N-Lübbecke und der SV Post Schwerin, aus der Staffel Süd die HSG Düsseldorf in die 1. Handball-Bundesliga auf.

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